Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BPIFA3Q9BQP9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms