Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYT12Q8IV01 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT12Q8IV01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT12Q8IV01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms