Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ClmnQ8C5W0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClmnQ8C5W0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ClmnQ8C5W0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClmnQ8C5W0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms