Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl2Q8BG73 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl2Q8BG73 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl2Q8BG73 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl2Q8BG73 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bgrl2Q8BG73 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrl2Q8BG73 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms