Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNT2Q6UVM3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNT2Q6UVM3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNT2Q6UVM3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNT2Q6UVM3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNT2Q6UVM3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms