Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 SUF3tG(CCC)D 72 nt7□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 SUA5YGL169W 1281 nt7□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 RAI1YGL246C 1164 nt7□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 FCY2YER056C 1602 nt7□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 ATG23YLR431C 1362 nt6.99□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 PEX12YMR026C 1200 nt6.99□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 CST26YBR042C 1194 nt6.99□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 snR30snR30 606 nt6.99□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 FRT1YOR324C 1809 nt6.99□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 NFS1YCL017C 1494 nt6.98□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 YOR300WYOR300W 309 nt6.98□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 MRI1YPR118W 1236 nt6.98□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 YPR130CYPR130C 408 nt6.98□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 SVF1YDR346C 1446 nt6.98□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 PRB1YEL060C 1908 nt6.97□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 PET117YER058W 324 nt6.97□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 SNU71YGR013W 1863 nt6.97□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 TAF11YML015C 1041 nt6.97□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 MRPL24YMR193W 777 nt6.97□□□□□ -1.29
UPC2Q12151 ECM10YEL030W 1935 nt6.96□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 ORM1YGR038W 669 nt6.96□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 YMR114CYMR114C 1107 nt6.96□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 TRR2YHR106W 1029 nt6.95□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 ATP10YLR393W 840 nt6.95□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 ZIM17YNL310C 525 nt6.95□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 DPM1YPR183W 804 nt6.95□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 SDH8YBR269C 417 nt6.95□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.94□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 GGC1YDL198C 903 nt6.94□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 YNR048WYNR048W 1182 nt6.94□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 PHO85YPL031C 918 nt6.94□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 YPL168WYPL168W 1293 nt6.94□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 YCL049CYCL049C 939 nt6.94□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 HOG1YLR113W 1308 nt6.94□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 LAT1YNL071W 1449 nt6.93□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 CIT3YPR001W 1461 nt6.93□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 CTA1YDR256C 1548 nt6.93□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 PRS4YBL068W 981 nt6.93□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 TOD6YBL054W 1578 nt6.93□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 CAN1YEL063C 1773 nt6.92□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 YHR140WYHR140W 720 nt6.92□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 YHC3YJL059W 1227 nt6.92□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 YMR253CYMR253C 1245 nt6.92□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 YOL079WYOL079W 399 nt6.92□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 PLB2YMR006C 2121 nt6.91□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 YOX1YML027W 1158 nt6.91□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 AVO2YMR068W 1281 nt6.91□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 ERR3YMR323W 1314 nt6.91□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 ERR1YOR393W 1314 nt6.91□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 ERR2YPL281C 1314 nt6.91□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 CDS1YBR029C 1374 nt6.91□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 REV7YIL139C 738 nt6.9□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 LOT6YLR011W 576 nt6.9□□□□□ -1.3
UPC2Q12151 DML1YMR211W 1428 nt6.9□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 YPQ2YDR352W 954 nt6.89□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 YER137CYER137C 447 nt6.89□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 OST3YOR085W 1053 nt6.89□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 snR34snR34 203 nt6.89□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 YEL023CYEL023C 2049 nt6.88□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 HPT1YDR399W 666 nt6.88□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 MAD2YJL030W 591 nt6.88□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 YLR036CYLR036C 612 nt6.88□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 SUN4YNL066W 1263 nt6.88□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 GET4YOR164C 939 nt6.88□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 CTF3YLR381W 2202 nt6.88□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 BRN1YBL097W 2265 nt6.87□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 MPE1YKL059C 1326 nt6.87□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 AI3Q0060 1248 nt6.87□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 CIA1YDR267C 993 nt6.87□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.87□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 RPL43AYPR043W 279 nt6.87□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 CDC10YCR002C 969 nt6.86□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 YAL045CYAL045C 309 nt6.86□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 DBR1YKL149C 1218 nt6.86□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 SED5YLR026C 1023 nt6.86□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 YLR162WYLR162W 357 nt6.86□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 TIF34YMR146C 1044 nt6.86□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 COS10YNR075W 1125 nt6.86□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 YLL058WYLL058W 1728 nt6.85□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 NDE1YMR145C 1683 nt6.85□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 THR1YHR025W 1074 nt6.85□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 YBR138CYBR138C 1575 nt6.84□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 AIM46YHR199C 933 nt6.84□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 SML1YML058W 315 nt6.84□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 AFG2YLR397C 2343 nt6.84□□□□□ -1.31
UPC2Q12151 IRC5YFR038W 2562 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 TUB1YML085C 1344 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 AQR1YNL065W 1761 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 STF1YDL130W-A 261 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 TRP1YDR007W 675 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 SHO1YER118C 1104 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 YIP4YGL198W 708 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 MCP1YOR228C 909 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 APE4YHR113W 1473 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 MSG5YNL053W 1470 nt6.83□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 ISR1YPR106W 1332 nt6.82□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt6.82□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 RSA3YLR221C 663 nt6.82□□□□□ -1.32
UPC2Q12151 HTZ1YOL012C 405 nt6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms