Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrp1P97333 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nrp1P97333 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrp1P97333 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrp1P97333 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrp1P97333 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms