Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFI35P80217 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFI35P80217 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFI35P80217 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFI35P80217 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFI35P80217 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFI35P80217 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFI35P80217 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFI35P80217 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFI35P80217 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFI35P80217 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFI35P80217 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFI35P80217 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFI35P80217 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFI35P80217 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFI35P80217 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFI35P80217 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFI35P80217 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFI35P80217 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFI35P80217 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFI35P80217 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFI35P80217 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFI35P80217 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFI35P80217 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFI35P80217 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFI35P80217 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFI35P80217 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFI35P80217 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFI35P80217 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IFI35P80217 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFI35P80217 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFI35P80217 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IFI35P80217 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IFI35P80217 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFI35P80217 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFI35P80217 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFI35P80217 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFI35P80217 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFI35P80217 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFI35P80217 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFI35P80217 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFI35P80217 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFI35P80217 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFI35P80217 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFI35P80217 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFI35P80217 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFI35P80217 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFI35P80217 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFI35P80217 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFI35P80217 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFI35P80217 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFI35P80217 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFI35P80217 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFI35P80217 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFI35P80217 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFI35P80217 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFI35P80217 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFI35P80217 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFI35P80217 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFI35P80217 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFI35P80217 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFI35P80217 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFI35P80217 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFI35P80217 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFI35P80217 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFI35P80217 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFI35P80217 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFI35P80217 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFI35P80217 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFI35P80217 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFI35P80217 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFI35P80217 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFI35P80217 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFI35P80217 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFI35P80217 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFI35P80217 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFI35P80217 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFI35P80217 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFI35P80217 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFI35P80217 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms