Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG3P56975 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NRG3P56975 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG3P56975 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG3P56975 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG3P56975 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG3P56975 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG3P56975 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRG3P56975 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRG3P56975 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRG3P56975 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRG3P56975 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NRG3P56975 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRG3P56975 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRG3P56975 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRG3P56975 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRG3P56975 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRG3P56975 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRG3P56975 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRG3P56975 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRG3P56975 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRG3P56975 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NRG3P56975 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRG3P56975 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRG3P56975 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRG3P56975 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRG3P56975 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRG3P56975 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRG3P56975 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NRG3P56975 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRG3P56975 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRG3P56975 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRG3P56975 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRG3P56975 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRG3P56975 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRG3P56975 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NRG3P56975 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRG3P56975 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRG3P56975 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRG3P56975 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRG3P56975 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NRG3P56975 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRG3P56975 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRG3P56975 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRG3P56975 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRG3P56975 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRG3P56975 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRG3P56975 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRG3P56975 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRG3P56975 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRG3P56975 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRG3P56975 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRG3P56975 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRG3P56975 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRG3P56975 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRG3P56975 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRG3P56975 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRG3P56975 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRG3P56975 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRG3P56975 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRG3P56975 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRG3P56975 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRG3P56975 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRG3P56975 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NRG3P56975 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRG3P56975 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRG3P56975 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRG3P56975 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRG3P56975 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRG3P56975 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRG3P56975 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRG3P56975 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRG3P56975 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRG3P56975 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRG3P56975 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRG3P56975 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRG3P56975 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRG3P56975 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRG3P56975 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRG3P56975 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRG3P56975 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRG3P56975 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRG3P56975 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRG3P56975 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRG3P56975 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRG3P56975 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRG3P56975 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRG3P56975 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRG3P56975 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRG3P56975 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRG3P56975 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRG3P56975 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NRG3P56975 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRG3P56975 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRG3P56975 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRG3P56975 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRG3P56975 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRG3P56975 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRG3P56975 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRG3P56975 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms