Protein–RNA interactions for Protein: P36100

TFA1, Transcription initiation factor IIE subunit alpha, yeastyeast

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFA1P36100 SKI6YGR195W 741 nt12.02□□□□□ -0.49
TFA1P36100 RPS14BYJL191W 417 nt12.02□□□□□ -0.49
TFA1P36100 CSM3YMR048W 954 nt12.02□□□□□ -0.49
TFA1P36100 CLP1YOR250C 1338 nt12.01□□□□□ -0.49
TFA1P36100 NCS6YGL211W 1080 nt12□□□□□ -0.49
TFA1P36100 POP6YGR030C 477 nt12□□□□□ -0.49
TFA1P36100 ERG20YJL167W 1059 nt12□□□□□ -0.49
TFA1P36100 PEX2YJL210W 816 nt12□□□□□ -0.49
TFA1P36100 OSW5YMR148W 447 nt12□□□□□ -0.49
TFA1P36100 SMM1YNR015W 1155 nt12□□□□□ -0.49
TFA1P36100 SEC61YLR378C 1443 nt12□□□□□ -0.49
TFA1P36100 YLR345WYLR345W 1530 nt12□□□□□ -0.49
TFA1P36100 MTF1YMR228W 1026 nt11.99□□□□□ -0.49
TFA1P36100 OPI10YOL032W 741 nt11.99□□□□□ -0.49
TFA1P36100 MET16YPR167C 786 nt11.99□□□□□ -0.49
TFA1P36100 HXT7YDR342C 1713 nt11.99□□□□□ -0.49
TFA1P36100 HXT6YDR343C 1713 nt11.99□□□□□ -0.49
TFA1P36100 DRN1YGR093W 1524 nt11.98□□□□□ -0.49
TFA1P36100 STF1YDL130W-A 261 nt11.98□□□□□ -0.49
TFA1P36100 DDI1YER143W 1287 nt11.98□□□□□ -0.49
TFA1P36100 IRC6YFR043C 714 nt11.98□□□□□ -0.49
TFA1P36100 KSS1YGR040W 1107 nt11.98□□□□□ -0.49
TFA1P36100 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt11.98□□□□□ -0.49
TFA1P36100 UPS3YDR185C 540 nt11.97□□□□□ -0.49
TFA1P36100 SHE9YDR393W 1371 nt11.96□□□□□ -0.49
TFA1P36100 HPM1YIL110W 1134 nt11.96□□□□□ -0.49
TFA1P36100 YAL066WYAL066W 309 nt11.96□□□□□ -0.49
TFA1P36100 FIT3YOR383C 615 nt11.96□□□□□ -0.49
TFA1P36100 NOP7YGR103W 1818 nt11.95□□□□□ -0.5
TFA1P36100 DAL7YIR031C 1665 nt11.95□□□□□ -0.5
TFA1P36100 MOB2YFL034C-B 864 nt11.95□□□□□ -0.5
TFA1P36100 SPO74YGL170C 1242 nt11.95□□□□□ -0.5
TFA1P36100 RBG1YAL036C 1110 nt11.95□□□□□ -0.5
TFA1P36100 SLZ1YNL196C 897 nt11.95□□□□□ -0.5
TFA1P36100 CSL4YNL232W 879 nt11.95□□□□□ -0.5
TFA1P36100 RIT1YMR283C 1542 nt11.93□□□□□ -0.5
TFA1P36100 SHY1YGR112W 1170 nt11.93□□□□□ -0.5
TFA1P36100 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt11.93□□□□□ -0.5
TFA1P36100 YAR028WYAR028W 705 nt11.93□□□□□ -0.5
TFA1P36100 RPC19YNL113W 429 nt11.93□□□□□ -0.5
TFA1P36100 CBP6YBR120C 489 nt11.93□□□□□ -0.5
TFA1P36100 TEC1YBR083W 1461 nt11.93□□□□□ -0.5
TFA1P36100 NSE5YML023C 1671 nt11.93□□□□□ -0.5
TFA1P36100 HAS1YMR290C 1518 nt11.92□□□□□ -0.5
TFA1P36100 GIC2YDR309C 1152 nt11.92□□□□□ -0.5
TFA1P36100 ERG25YGR060W 930 nt11.92□□□□□ -0.5
TFA1P36100 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt11.92□□□□□ -0.5
TFA1P36100 KRE9YJL174W 831 nt11.92□□□□□ -0.5
TFA1P36100 RSM26YJR101W 801 nt11.92□□□□□ -0.5
TFA1P36100 HMRA1YCR097W 381 nt11.91□□□□□ -0.5
TFA1P36100 CWC15YDR163W 528 nt11.91□□□□□ -0.5
TFA1P36100 CPR6YLR216C 1116 nt11.91□□□□□ -0.5
TFA1P36100 YOR097CYOR097C 528 nt11.91□□□□□ -0.5
TFA1P36100 ECM8YBR076W 1065 nt11.91□□□□□ -0.5
TFA1P36100 ILV3YJR016C 1758 nt11.91□□□□□ -0.5
TFA1P36100 DBP1YPL119C 1854 nt11.91□□□□□ -0.5
TFA1P36100 SFK1YKL051W 1062 nt11.9□□□□□ -0.5
TFA1P36100 MRPL15YLR312W-A 762 nt11.9□□□□□ -0.5
TFA1P36100 LAP2YNL045W 2016 nt11.89□□□□□ -0.51
TFA1P36100 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.89□□□□□ -0.51
TFA1P36100 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.89□□□□□ -0.51
TFA1P36100 SAM3YPL274W 1764 nt11.89□□□□□ -0.51
TFA1P36100 YHL012WYHL012W 1482 nt11.89□□□□□ -0.51
TFA1P36100 KCH1YJR054W 1494 nt11.89□□□□□ -0.51
TFA1P36100 YUH1YJR099W 711 nt11.88□□□□□ -0.51
TFA1P36100 SBA1YKL117W 651 nt11.88□□□□□ -0.51
TFA1P36100 PBP2YBR233W 1242 nt11.88□□□□□ -0.51
TFA1P36100 YMR027WYMR027W 1413 nt11.87□□□□□ -0.51
TFA1P36100 PRP19YLL036C 1512 nt11.87□□□□□ -0.51
TFA1P36100 JIP4YDR475C 2631 nt11.87□□□□□ -0.51
TFA1P36100 HIS2YFR025C 1008 nt11.87□□□□□ -0.51
TFA1P36100 HRT3YLR097C 1035 nt11.87□□□□□ -0.51
TFA1P36100 LUC7YDL087C 786 nt11.86□□□□□ -0.51
TFA1P36100 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt11.86□□□□□ -0.51
TFA1P36100 GET4YOR164C 939 nt11.86□□□□□ -0.51
TFA1P36100 MTG2YHR168W 1557 nt11.86□□□□□ -0.51
TFA1P36100 AIM6YDL237W 1173 nt11.85□□□□□ -0.51
TFA1P36100 RHO3YIL118W 696 nt11.85□□□□□ -0.51
TFA1P36100 URA5YML106W 681 nt11.85□□□□□ -0.51
TFA1P36100 CLN2YPL256C 1638 nt11.85□□□□□ -0.51
TFA1P36100 ECM7YLR443W 1347 nt11.85□□□□□ -0.51
TFA1P36100 GND2YGR256W 1479 nt11.84□□□□□ -0.51
TFA1P36100 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt11.84□□□□□ -0.51
TFA1P36100 YGL262WYGL262W 528 nt11.84□□□□□ -0.51
TFA1P36100 CIR1YGR207C 786 nt11.84□□□□□ -0.51
TFA1P36100 SMA1YPL027W 738 nt11.84□□□□□ -0.51
TFA1P36100 RSC2YLR357W 2670 nt11.83□□□□□ -0.51
TFA1P36100 ALP1YNL270C 1722 nt11.83□□□□□ -0.52
TFA1P36100 MAE1YKL029C 2010 nt11.83□□□□□ -0.52
TFA1P36100 YCR100CYCR100C 951 nt11.83□□□□□ -0.52
TFA1P36100 DFR1YOR236W 636 nt11.83□□□□□ -0.52
TFA1P36100 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt11.83□□□□□ -0.52
TFA1P36100 BET2YPR176C 978 nt11.83□□□□□ -0.52
TFA1P36100 RRT2YBR246W 1164 nt11.83□□□□□ -0.52
TFA1P36100 GLR1YPL091W 1452 nt11.83□□□□□ -0.52
TFA1P36100 YFL012WYFL012W 447 nt11.82□□□□□ -0.52
TFA1P36100 SRY1YKL218C 981 nt11.82□□□□□ -0.52
TFA1P36100 PSH1YOL054W 1221 nt11.82□□□□□ -0.52
TFA1P36100 GIP2YER054C 1647 nt11.82□□□□□ -0.52
TFA1P36100 TGL1YKL140W 1647 nt11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms