Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN2P32314 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN2P32314 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN2P32314 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms