Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTNP21246 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTNP21246 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTNP21246 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTNP21246 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTNP21246 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTNP21246 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTNP21246 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTNP21246 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTNP21246 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTNP21246 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTNP21246 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTNP21246 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTNP21246 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTNP21246 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTNP21246 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTNP21246 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTNP21246 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTNP21246 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTNP21246 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTNP21246 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTNP21246 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTNP21246 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTNP21246 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTNP21246 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTNP21246 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTNP21246 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTNP21246 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTNP21246 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTNP21246 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTNP21246 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTNP21246 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTNP21246 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTNP21246 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTNP21246 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTNP21246 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTNP21246 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTNP21246 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTNP21246 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTNP21246 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTNP21246 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTNP21246 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTNP21246 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTNP21246 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTNP21246 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTNP21246 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTNP21246 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTNP21246 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTNP21246 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTNP21246 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTNP21246 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTNP21246 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTNP21246 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTNP21246 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTNP21246 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTNP21246 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTNP21246 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTNP21246 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTNP21246 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTNP21246 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTNP21246 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTNP21246 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTNP21246 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTNP21246 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTNP21246 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTNP21246 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTNP21246 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTNP21246 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms