Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grik3B1AS29 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik3B1AS29 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik3B1AS29 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms