Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A8MVJ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A8MVJ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A8MVJ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A8MVJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A8MVJ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A8MVJ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A8MVJ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A8MVJ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A8MVJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A8MVJ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A8MVJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A8MVJ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MVJ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A8MVJ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A8MVJ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A8MVJ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A8MVJ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MVJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A8MVJ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A8MVJ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A8MVJ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A8MVJ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A8MVJ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A8MVJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A8MVJ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A8MVJ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A8MVJ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A8MVJ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A8MVJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A8MVJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A8MVJ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A8MVJ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
A8MVJ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A8MVJ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A8MVJ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A8MVJ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A8MVJ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A8MVJ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A8MVJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A8MVJ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A8MVJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A8MVJ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A8MVJ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A8MVJ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A8MVJ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A8MVJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A8MVJ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A8MVJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A8MVJ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A8MVJ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A8MVJ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A8MVJ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A8MVJ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A8MVJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A8MVJ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A8MVJ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A8MVJ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A8MVJ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A8MVJ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A8MVJ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A8MVJ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A8MVJ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A8MVJ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A8MVJ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A8MVJ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A8MVJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A8MVJ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
A8MVJ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A8MVJ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A8MVJ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A8MVJ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A8MVJ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A8MVJ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A8MVJ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A8MVJ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A8MVJ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A8MVJ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A8MVJ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A8MVJ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms