Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
A6NNZ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
A6NNZ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
A6NNZ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
A6NNZ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A6NNZ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A6NNZ2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A6NNZ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A6NNZ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A6NNZ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A6NNZ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A6NNZ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A6NNZ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A6NNZ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A6NNZ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A6NNZ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A6NNZ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A6NNZ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A6NNZ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A6NNZ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A6NNZ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A6NNZ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A6NNZ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A6NNZ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A6NNZ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A6NNZ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A6NNZ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A6NNZ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A6NNZ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A6NNZ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A6NNZ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A6NNZ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A6NNZ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A6NNZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A6NNZ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A6NNZ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A6NNZ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
A6NNZ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A6NNZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A6NNZ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A6NNZ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A6NNZ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A6NNZ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A6NNZ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A6NNZ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A6NNZ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A6NNZ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A6NNZ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A6NNZ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A6NNZ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A6NNZ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A6NNZ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A6NNZ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A6NNZ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A6NNZ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A6NNZ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A6NNZ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A6NNZ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A6NNZ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A6NNZ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A6NNZ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A6NNZ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
A6NNZ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A6NNZ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A6NNZ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A6NNZ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A6NNZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A6NNZ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A6NNZ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A6NNZ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A6NNZ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A6NNZ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A6NNZ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A6NNZ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A6NNZ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A6NNZ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A6NNZ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A6NNZ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A6NNZ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A6NNZ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A6NNZ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A6NNZ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A6NNZ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A6NNZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A6NNZ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A6NNZ2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A6NNZ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A6NNZ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A6NNZ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A6NNZ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A6NNZ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
A6NNZ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A6NNZ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A6NNZ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A6NNZ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A6NNZ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A6NNZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A6NNZ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A6NNZ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A6NNZ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms