Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
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BIVM-ERCC5R4GMW8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
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