Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNPO3Q9Y5L0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms