Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRELID3BQ9Y3B1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms