Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms