Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD4Q9ULV1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms