Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms