Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms