Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms