Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms