Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms