Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms