Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms