Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms