Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IL1RAPQ9NPH3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms