Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRDE2Q9H7Z3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms