Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GFRA4Q9GZZ7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms