Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BCL11BQ9C0K0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BCL11BQ9C0K0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BCL11BQ9C0K0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BCL11BQ9C0K0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL11BQ9C0K0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms