Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP4Q9C0A0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms