Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms