Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-6Q9BXR3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms