Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SALL3Q9BXA9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms