Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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