Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3GL2Q99962 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms