Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms