Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms