Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms