Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms