Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
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