Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MFSD3Q96ES6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms