Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms