Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNKSR2Q8WXI2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNKSR2Q8WXI2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms