Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms