Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP4Q8N3C7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms