Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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IFNL1Q8IU54 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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IFNL1Q8IU54 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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IFNL1Q8IU54 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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IFNL1Q8IU54 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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IFNL1Q8IU54 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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IFNL1Q8IU54 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNL1Q8IU54 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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