Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37DQ86XT2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms